L'emmagatzematge de PCB requereix un control acurat de les condicions ambientals, ja que aquest és un factor bàsic que afecta la vida útil i la fiabilitat. Els PCB són els més vulnerables a la humitat, les altes temperatures i els gasos corrosius de l'aire. Per tant, l'ambient d'emmagatzematge ideal ha de ser sec, a temperatura ambient i amb una ventilació estable. En general, es recomana controlar la humitat entre el 40% i el 60%. Si la humitat ambiental és massa alta, la PCB absorbirà fàcilment la humitat, provocant potencialment "explosió de la placa" o delaminació durant la soldadura per refluig posterior. L'exposició-a llarg termini a l'aire també farà que les pastilles de soldadura s'oxidin gradualment, afectant la soldabilitat. Per als taulers d'alta-precisió o els que s'emmagatzemen durant llargs períodes, normalment es col·loquen en un armari de deshumidificació o en un embalatge-segellat a prova d'humitat-, juntament amb els dessecants, per reduir l'impacte de la humitat.
L'embalatge i la col·locació també són importants. Les diferents etapes del desenvolupament de PCB requereixen diferents nivells de protecció. Els taulers nus no muntats generalment es tanquen en bosses anti-estàtiques per evitar l'acumulació d'electricitat estàtica i l'oxidació del metall. Per als PCBA amb components muntats, cal un material d'amortiment addicional per evitar danys per col·lisió durant el transport o la manipulació. S'ha d'evitar l'apilament pesat durant l'emmagatzematge, especialment per a taulers multicapa o taulers de -gran mida, ja que la tensió prolongada pot provocar una lleugera deformació o fins i tot canvis en la tensió estructural interna. A l'emmagatzematge, no es recomana el contacte directe amb el sòl ni la proximitat a les parets per minimitzar l'impacte del retorn d'humitat i les fluctuacions de temperatura.
Per a l'emmagatzematge a llarg termini o la gestió d'inventari, també s'han de tenir en compte les inspeccions periòdiques i el control de la data de caducitat. Els PCB no són productes que es puguin emmagatzemar indefinidament. Fins i tot en bons entorns, les capes de tractament superficial (com ara OSP, or d'immersió i revestiment de soldadura) envelliran lentament amb el temps. Per tant, normalment s'estableixen cicles d'inventari, com ara la re-inspecció cada 3 o 6 mesos. La re-inspecció inclou la comprovació de l'oxidació, els canvis en el color dels coixinets i la integritat de l'embalatge-a prova d'humitat. Si es troba una lleugera oxidació, la soldabilitat es pot restaurar mitjançant una neteja o reprocessament professional.
